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编号:13177587
一个新的丹参3羟基3甲基戊二酰辅酶A还原酶3基因的克隆及其表达分析(1)
http://www.100md.com 2012年8月15日 张夏楠 郭娟 申业 黄璐琦
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     [摘要] 目的:对丹参3羟基3甲基戊二酰辅酶A还原酶(3hydroxy3methylglutary CoA reductase,HMGR3)基因的cDNA克隆并进行序列分析。方法:利用丹参转录组文库克隆一种新的丹参次生代谢途径上的功能基因;利用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找开放阅读框,Clustal W比对丹参中已有的3条HMGR的氨基酸序列,构建系统进化树,QRTPCR检测丹参HMGR3基因在根、茎、叶中的mRNA水平,并检测Ag+诱导子诱导后丹参毛状根中该基因的转录水平。结果:克隆得到一个新的丹参HMGR3基因,该基因ORF全长1 692 bp,编码563个氨基酸,具有HMGR基因家族的特征序列,与SmHMGR1和SmHMGR2分别具有75.04%,80.64%的同源性,QRTPCR 分析表明该基因在丹参根茎叶中均有表达,在叶中表达量最高,Ag+诱导24 h时mRNA水平达到最高值。结论:首次克隆得到了1条新的丹参HMGR家族基因SmHMGR3,这一结果为进一步研究丹参次生代谢途径提供了新的思路和靶点。

    [关键词] 丹参;3羟基3甲基戊二酰辅酶A还原酶;QRTPCR

    萜类化合物在自然界中分布广泛,是植物次生代谢物质中最大的一个家族,其生物合成途径由甲羟戊酸途径(MVA)和赤藓糖磷酸途径(MEP)组成。MVA途径由Conrad Bloch 和Feodor Lynen于1958年首先在动物和酵母中发现,长期以来都被认为是萜类化合物生物合成的唯一途径,存在于细胞质中,因此又称为细胞质途径(cytosolic pathway) ......

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